Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A5Q9BY07 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC4A5Q9BY07 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A5Q9BY07 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A5Q9BY07 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms