Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1QTNF3Q9BXJ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1QTNF3Q9BXJ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms