Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP5Q9BXF6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms