Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIOK2Q9BVS4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIOK2Q9BVS4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIOK2Q9BVS4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RIOK2Q9BVS4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK2Q9BVS4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK2Q9BVS4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK2Q9BVS4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK2Q9BVS4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIOK2Q9BVS4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms