Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KATNB1Q9BVA0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KATNB1Q9BVA0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KATNB1Q9BVA0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms