Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNPPD1Q9BV87 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNPPD1Q9BV87 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms