Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VAMP8Q9BV40 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP8Q9BV40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms