Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTP6

ZBED2, Zinc finger BED domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED2Q9BTP6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZBED2Q9BTP6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED2Q9BTP6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZBED2Q9BTP6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED2Q9BTP6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZBED2Q9BTP6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED2Q9BTP6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED2Q9BTP6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED2Q9BTP6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED2Q9BTP6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZBED2Q9BTP6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZBED2Q9BTP6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms