Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTKNQ9BST9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTKNQ9BST9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTKNQ9BST9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms