Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBGCP2Q9BSJ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBGCP2Q9BSJ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms