Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM246Q9BRR3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM246Q9BRR3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM246Q9BRR3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms