Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF559Q9BR84 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF559Q9BR84 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms