Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C20orf78Q9BR46 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf78Q9BR46 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms