Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN3Q9BQT9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN3Q9BQT9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSTN3Q9BQT9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms