Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYT3Q9BQG1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT3Q9BQG1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT3Q9BQG1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms