Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM7Q9BQ49 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM7Q9BQ49 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms