Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM4BQ9BQ04 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM4BQ9BQ04 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM4BQ9BQ04 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms