Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMKLR1Q99788 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMKLR1Q99788 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMKLR1Q99788 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMKLR1Q99788 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMKLR1Q99788 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMKLR1Q99788 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CMKLR1Q99788 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMKLR1Q99788 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMKLR1Q99788 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMKLR1Q99788 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMKLR1Q99788 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CMKLR1Q99788 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMKLR1Q99788 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMKLR1Q99788 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMKLR1Q99788 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CMKLR1Q99788 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMKLR1Q99788 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms