Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPAS1Q99742 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPAS1Q99742 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPAS1Q99742 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms