Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARD1Q99728 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARD1Q99728 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
BARD1Q99728 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms