Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMP4Q99727 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMP4Q99727 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 676.8 ms