Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTRQ99707 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTRQ99707 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTRQ99707 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTRQ99707 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTRQ99707 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MTRQ99707 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTRQ99707 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTRQ99707 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTRQ99707 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTRQ99707 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTRQ99707 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTRQ99707 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTRQ99707 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTRQ99707 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MTRQ99707 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTRQ99707 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MTRQ99707 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTRQ99707 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTRQ99707 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTRQ99707 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTRQ99707 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTRQ99707 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTRQ99707 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTRQ99707 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTRQ99707 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTRQ99707 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTRQ99707 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTRQ99707 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTRQ99707 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTRQ99707 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTRQ99707 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTRQ99707 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTRQ99707 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTRQ99707 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTRQ99707 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTRQ99707 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTRQ99707 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTRQ99707 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTRQ99707 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTRQ99707 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTRQ99707 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTRQ99707 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTRQ99707 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTRQ99707 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTRQ99707 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTRQ99707 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTRQ99707 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTRQ99707 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTRQ99707 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MTRQ99707 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MTRQ99707 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MTRQ99707 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTRQ99707 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTRQ99707 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTRQ99707 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTRQ99707 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTRQ99707 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTRQ99707 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTRQ99707 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTRQ99707 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTRQ99707 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTRQ99707 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTRQ99707 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTRQ99707 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTRQ99707 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTRQ99707 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MTRQ99707 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTRQ99707 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTRQ99707 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTRQ99707 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTRQ99707 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTRQ99707 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MTRQ99707 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTRQ99707 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTRQ99707 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTRQ99707 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTRQ99707 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MTRQ99707 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MTRQ99707 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MTRQ99707 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTRQ99707 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MTRQ99707 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTRQ99707 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTRQ99707 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTRQ99707 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTRQ99707 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTRQ99707 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTRQ99707 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms