Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ELF4Q99607 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ELF4Q99607 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ELF4Q99607 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ELF4Q99607 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms