Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFDN5Q99471 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PFDN5Q99471 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PFDN5Q99471 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 372.9 ms