Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT12Q99456 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT12Q99456 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT12Q99456 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT12Q99456 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms