Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF607Q96SK3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF607Q96SK3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF607Q96SK3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF607Q96SK3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF607Q96SK3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF607Q96SK3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF607Q96SK3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF607Q96SK3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF607Q96SK3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF607Q96SK3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF607Q96SK3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF607Q96SK3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF607Q96SK3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF607Q96SK3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF607Q96SK3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms