Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms