Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PRAM1Q96QH2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PRAM1Q96QH2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PRAM1Q96QH2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
PRAM1Q96QH2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRAM1Q96QH2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PRAM1Q96QH2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRAM1Q96QH2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PRAM1Q96QH2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRAM1Q96QH2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRAM1Q96QH2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRAM1Q96QH2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PRAM1Q96QH2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms