Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
LMTK3Q96Q04 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LMTK3Q96Q04 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
LMTK3Q96Q04 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LMTK3Q96Q04 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LMTK3Q96Q04 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms