Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCZQ96LD1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGCZQ96LD1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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