Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ALPK3Q96L96 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALPK3Q96L96 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALPK3Q96L96 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALPK3Q96L96 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALPK3Q96L96 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms