Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPZA3Q96KX2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPZA3Q96KX2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms