Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LOXL4Q96JB6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LOXL4Q96JB6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LOXL4Q96JB6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms