Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZC2HC1AQ96GY0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms