Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC10A4Q96EP9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC10A4Q96EP9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC10A4Q96EP9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC10A4Q96EP9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms