Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF21BQ96EK2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF21BQ96EK2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.5 ms