Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
YIPF6Q96EC8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YIPF6Q96EC8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF6Q96EC8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YIPF6Q96EC8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF6Q96EC8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF6Q96EC8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF6Q96EC8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF6Q96EC8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF6Q96EC8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YIPF6Q96EC8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms