Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC74AQ96AQ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC74AQ96AQ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC74AQ96AQ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74AQ96AQ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms