Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSLPQ969D9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSLPQ969D9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSLPQ969D9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 478.4 ms