Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHKBQ93100 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHKBQ93100 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHKBQ93100 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms