Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HGDQ93099 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HGDQ93099 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HGDQ93099 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HGDQ93099 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HGDQ93099 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HGDQ93099 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HGDQ93099 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HGDQ93099 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HGDQ93099 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HGDQ93099 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HGDQ93099 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HGDQ93099 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HGDQ93099 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HGDQ93099 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HGDQ93099 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HGDQ93099 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HGDQ93099 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HGDQ93099 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HGDQ93099 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HGDQ93099 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HGDQ93099 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HGDQ93099 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HGDQ93099 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HGDQ93099 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HGDQ93099 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HGDQ93099 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HGDQ93099 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HGDQ93099 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HGDQ93099 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HGDQ93099 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HGDQ93099 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HGDQ93099 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HGDQ93099 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HGDQ93099 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HGDQ93099 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HGDQ93099 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HGDQ93099 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HGDQ93099 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HGDQ93099 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HGDQ93099 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HGDQ93099 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HGDQ93099 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HGDQ93099 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HGDQ93099 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HGDQ93099 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HGDQ93099 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HGDQ93099 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HGDQ93099 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HGDQ93099 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HGDQ93099 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HGDQ93099 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HGDQ93099 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HGDQ93099 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HGDQ93099 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HGDQ93099 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HGDQ93099 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HGDQ93099 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HGDQ93099 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HGDQ93099 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HGDQ93099 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HGDQ93099 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HGDQ93099 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HGDQ93099 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HGDQ93099 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HGDQ93099 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HGDQ93099 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HGDQ93099 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HGDQ93099 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HGDQ93099 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HGDQ93099 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HGDQ93099 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HGDQ93099 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HGDQ93099 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HGDQ93099 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HGDQ93099 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HGDQ93099 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HGDQ93099 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms