Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLP1Q92989 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLP1Q92989 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms