Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UFD1Q92890 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UFD1Q92890 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UFD1Q92890 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UFD1Q92890 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFD1Q92890 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UFD1Q92890 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFD1Q92890 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFD1Q92890 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UFD1Q92890 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFD1Q92890 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFD1Q92890 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFD1Q92890 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFD1Q92890 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFD1Q92890 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UFD1Q92890 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UFD1Q92890 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFD1Q92890 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFD1Q92890 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFD1Q92890 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UFD1Q92890 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UFD1Q92890 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UFD1Q92890 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UFD1Q92890 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UFD1Q92890 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UFD1Q92890 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UFD1Q92890 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UFD1Q92890 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFD1Q92890 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFD1Q92890 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFD1Q92890 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFD1Q92890 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFD1Q92890 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UFD1Q92890 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFD1Q92890 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFD1Q92890 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFD1Q92890 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UFD1Q92890 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFD1Q92890 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFD1Q92890 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFD1Q92890 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFD1Q92890 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UFD1Q92890 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFD1Q92890 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFD1Q92890 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFD1Q92890 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UFD1Q92890 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms