Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHF3Q92576 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF3Q92576 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF3Q92576 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms