Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPDL3BQ92485 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMPDL3BQ92485 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPDL3BQ92485 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms