Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB2BQ8WUD1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB2BQ8WUD1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms