Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.54■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L4Q8WU68 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L4Q8WU68 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms