Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTRT1Q8TDG2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms