Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC110Q8TBZ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC110Q8TBZ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC110Q8TBZ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC110Q8TBZ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC110Q8TBZ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC110Q8TBZ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC110Q8TBZ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC110Q8TBZ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC110Q8TBZ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC110Q8TBZ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms