Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNIH3Q8TBE1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNIH3Q8TBE1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms